Bien-être. Le nombre de décès dus aux infections fongiques dans le monde a doublé en dix ans selon une nouvelle étude

Il y a onze ans, mes collègues et moi estimions qu’environ deux millions de personnes dans le monde mouraient chaque année d’infections fongiques. Mes dernières estimations portent ce chiffre à près du double : environ 3,8 millions de décès. Pour mettre cela en perspective, cela représente environ 6,8 % de la mortalité mondiale. Les maladies coronariennes sont probablement responsables de 16 % des décès dans le monde, suivies des accidents vasculaires cérébraux (AVC) à 11 %. Les maladies pulmonaires liées au tabagisme (BPCO) représentent 6 % de la mortalité totale, les infections fongiques étant responsables d’environ un tiers de ces 3 228 000 décès.

D’autres statistiques comparatives sur la mortalité mondiale font état de 2 600 000 décès dus à la pneumonie (dont certains d’origine fongique) et de 1 208 000 décès dus à la tuberculose (dont 340 000 décès probablement dus à des maladies fongiques non diagnostiquées).

Pour parvenir à ces estimations – publiées dans Lancet Infectious Diseases– j’ai évalué la proportion de cas de mycoses effectivement diagnostiqués et traités, ainsi que celle de cas non diagnostiqués. Bien que le diagnostic des mycoses se soit considérablement amélioré ces dix à quinze dernières années, l’accès à ces tests et leur utilisation restent limités, et ce, pas seulement dans les pays à faible revenu.

Par exemple, l’Afrique du Sud dispose d’un service de diagnostic performant pour la méningite fongique (cryptococcique) et les candidoses, mais ne possède aucun outil diagnostique pour les infections causées par un autre champignon très répandu, l’Aspergillus. Ces lacunes contribuent largement à des décès évitables. En particulier, un diagnostic rapide des infections graves à Aspergillus, idéalement dans les 48 heures, pourrait sauver des millions de vies chaque année.

Les champignons les plus mortels sont Aspergillus fumigatus et Aspergillus flavus, responsables d’infections pulmonaires. Parmi les personnes touchées figurent celles atteintes de maladies pulmonaires telles que l’asthme, la tuberculose et le cancer du poumon, mais aussi celles atteintes de leucémie, celles ayant subi une transplantation d’organe et celles hospitalisées en soins intensifs.

Nombre de ces personnes décèdent parce que leur médecin ne diagnostique pas leur mycose, ou le diagnostique trop tard. Mais beaucoup de décès sont également dus à la lenteur ou à l’absence de diagnostic et au manque de médicaments antifongiques efficaces. Les tests basés sur la culture fongique n’identifient qu’environ un tiers des personnes atteintes d’une infection fongique.

Malheureusement, comme pour la résistance aux antibiotiques, la résistance aux antifongiques est elle aussi un problème croissant. La pulvérisation de certains fongicides sur les cultures accroît considérablement les taux de résistance à une famille d’antifongiques, les azoles.

Les infections à Candida sont une cause de septicémie et se retrouvent dans le sang. Elles sont également liées au diabète ou à l’insuffisance rénale, voire aux deux, et peuvent survenir après une intervention chirurgicale majeure ou un traumatisme. Ce champignon fait normalement partie du microbiote intestinal, mais en cas de maladie grave, il traverse la paroi intestinale et passe dans le sang.

Avec plus de 1,5 million de personnes touchées dans le monde par des infections à Candida potentiellement mortelles, et près d’un million de décès chaque année, il est urgent de disposer de meilleurs tests de diagnostic. Les hémocultures actuelles ne détectent que 40 % des infections àCandida potentiellement mortelles.

Environ 50 % des quelque 600 000 décès dus au sida sont attribuables à des infections fongiques

D’importants efforts sont déployés à l’échelle mondiale pour éradiquer la méningite cryptococcique comme cause de mortalité, notamment sous l’égide des Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) et de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS).

Concernant le sida, des efforts considérables restent nécessaires pour étudier l’histoplasmose en Afrique et en Asie du Sud-Est, en utilisant des tests plus performants. Trop de patients sont diagnostiqués à tort comme atteints de tuberculose, ou présentent une co-infection tuberculeuse, sans que l’infection à Histoplasma, potentiellement mortelle, ne soit diagnostiquée ni traitée.

Le champignon noir

La première épidémie mondiale de mucormycose à grande échelle, survenue après la Covid-19 en Inde, est due à la maladie du champignon noir. Ce champignon bloque l’irrigation sanguine des tissus, entraînant leur nécrose, d’où son nom courant de « champignon noir ».

En 2012, mes collègues et moi estimions à environ 10 000 le nombre de cas de mucormycose dans le monde. La pandémie de Covid-19 en Inde a entraîné au moins 51 000 cas déclarés, une augmentation massive attribuable à des facteurs tels que le recours excessif aux stéroïdes pour traiter la Covid-19 (doses trop élevées et durée trop longue) et un diabète mal contrôlé.

Les infections à Aspergillus et à Candida étaient également beaucoup plus fréquentes chez les patients atteints de Covid-19 en soins intensifs dans le monde entier. En effet, le pic de mycoses associé à la Covid-19 n’a pas été pris en compte dans l’élaboration de ces nouvelles données publiées sur l’incidence et la mortalité liées aux mycoses, ces chiffres pourraient donc être encore plus élevés.

Une double épreuve

Les personnes admises en soins intensifs pour une grippe présentent également une forte incidence d’infections à Aspergillus potentiellement mortelles, ce qui double le risque de décès, même en cas de diagnostic d’aspergillose. De fait, les médecins et les scientifiques craignent une double épidémie d’infections fongiques et de grippe ou d’un autre virus respiratoire.

Il existe également une forte corrélation entre l’allergie fongique et l’asthme sévère ou mal contrôlé.

L’asthme est une maladie fréquente qui devient de plus en plus problématique avec l’âge. Les personnes souffrant d’asthme fongique ont généralement besoin de plusieurs médicaments et subissent des crises, des consultations aux urgences et des hospitalisations.

Malgré tous les efforts déployés pour contrôler l’asthme, on estime que 461 000 personnes en meurent chaque année dans le monde, soit à cause de cette maladie, soit parce qu’elle fait partie de leur maladie terminale.

Les maladies fongiques sont là pour rester. Elles sont partout autour de nous et colonisent notre intestin et notre peau.

Il n’existe aucun vaccin contre les champignons. Les mycoses graves surviennent généralement chez les personnes déjà malades, à quelques exceptions près chez les personnes en bonne santé et celles vivant ou travaillant dans des environnements insalubres. C’est pourquoi un diagnostic précis et rapide est absolument essentiel, et pourquoi nous devons prendre les mycoses très au sérieux.

Rédacteur Fetty Adler
Collaborateur Jo Ann

Auteur : David W. Denning. Chercheur principal, Groupe de recherche sur les infections fongiques de Manchester, Université de Manchester. Cet article est republié du site The Conversation,  sous licence Creative Commons.

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