On a beaucoup écrit et parlé du microbiome intestinal, cet ensemble de bactéries, virus, champignons et archées qui vit dans nos intestins. Mais l’intestin n’est pas le seul endroit à posséder un microbiome. La bouche, le nez, la peau, les poumons et les organes génitaux ont également leur propre microbiome. Alors, tous jouent un rôle important dans notre santé.
Voici une brève introduction pour chacun d’eux.
Le microbiome oral
On peut affirmer qu’il s’agit du premier microbiome découvert.
À la fin du XVIIe siècle, Antonie van Leeuwenhoek, un scientifique néerlandais, préleva des cellules de sa bouche et les examina au microscope. Il y découvrit « une multitude de minuscules animalcules vivants, qui se déplaçaient avec une grande grâce ». Aujourd’hui, nous savons qu’il existe bien plus que de simples « animalcules », comme les appelait Van Leeuwenhoek pour désigner les bactéries, mais aussi des champignons et des virus.
Cet ensemble de microbes, entre autres, facilite la digestion en décomposant les glucides complexes en sucres plus simples, ce qui permet à l’intestin de les absorber plus facilement.
Comme tous les microbiomes, le microbiome buccal est en compétition avec les bactéries nocives pour les ressources et l’espace. Un déséquilibre de la flore buccale peut entraîner des caries, des maladies des gencives et des infections .
Une bonne hygiène buccale et une alimentation saine peuvent assurer la prédominance des bonnes bactéries.
Le microbiome nasal
En remontant vers le nord, on trouve le microbiome nasal, qui contribue à filtrer et à piéger les particules présentes dans l’air que nous respirons.
Bien que le microbiome nasal comprenne plus d’une centaine de souches de bactéries, seules deux à dix espèces constituent 90 % du microbiome.
Ces bactéries entretiennent une relation symbiotique : un échange de bons procédés est bénéfique. Cependant, des déséquilibres du microbiome nasal peuvent survenir suite à des facteurs environnementaux (comme la pollution atmosphérique), à des prédispositions génétiques ou à des problèmes du système immunitaire. Ces déséquilibres ont été associés à des affections telles que la sinusite chronique, les allergies nasales et un risque accru d’infections respiratoires.
Une petite étude portugaise a révélé que les dégustateurs de vin possèdent moins de bactéries nasales et une flore bactérienne moins diversifiée que les non-dégustateurs. Lucía Perez-Pardal, l’une des chercheuses, a expliqué à New Scientist que la molécule d’alcool déshydrate les bactéries. « Elle élimine l’eau de leurs membranes, ce qui provoque leur éclatement », a-t-elle déclaré. « Si l’on tue les bactéries de façon répétée, on ne leur laisse pas suffisamment de temps pour se reproduire. »
Le microbiome cutané
Une communauté complexe de micro-organismes vit à la surface de notre peau et dans ses couches plus profondes.
Le microbiome cutané comprend des bactéries, des champignons et des virus. Ces micro-organismes jouent un rôle important dans le maintien d’une peau saine et la protection contre les bactéries nocives.
Des déséquilibres du microbiome cutané ont été associés à des affections cutanées telles que l’acné, l’eczéma, le psoriasis et la dermatite.
Une étude publiée en début d’année, mais non encore évaluée par des pairs, a révélé que deux espèces bactériennes, Cutibacterium acnes et Staphylococcus epidermidis, étaient associées à une baisse du taux de collagène, la structure qui assure la jeunesse de la peau. De nouveaux traitements anti-âge ciblant ces bactéries devraient donc être commercialisés prochainement.
Le microbiome pulmonaire
La seule partie du corps longtemps considérée comme stérile possède elle aussi un microbiome . Le microbiome pulmonaire, composé principalement de bactéries, est moins diversifié que les autres microbiomes.
On pense que ces bactéries proviennent de la bouche et du nez, et qu’elles pénètrent dans les poumons lorsque nous inhalons de petites quantités de sécrétions orales et nasales.
Le microbiome pulmonaire joue un rôle dans les réponses immunitaires et la santé respiratoire . Des perturbations du microbiome pulmonaire peuvent nous rendre plus vulnérables aux infections et aux maladies respiratoires telles que l’asthme, la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO) et la pneumonie.
Le microbiome génital
Plus au sud, on trouve le microbiome vaginal chez les femmes et le microbiome pénien chez les hommes.
Chez la femme, le microbiome vaginal est principalement composé de bactéries, notamment de lactobacilles. Ce microbiome contribue au maintien d’un vagin sain en créant un environnement acide qui empêche la prolifération des bactéries nocives et favorise un équilibre de la flore vaginale.
Lorsque le microbiome vaginal est déséquilibré, cela peut entraîner des affections telles que la vaginose bactérienne et les mycoses vaginales.
Le microbiome pénien chez l’homme contribue également à la santé génitale, bien qu’il ait été moins étudié.
Un déséquilibre du microbiome pénien peut entraîner des affections telles que des infections urinaires.
Le microbiome intestinal
Le microbiome intestinal est l’un des microbiomes les plus connus et les plus influents de notre organisme. Il s’agit d’un vaste ensemble de micro-organismes, comprenant des bactéries, des virus, des champignons et des archées.
Le microbiome intestinal est essentiel à la digestion, au métabolisme et au développement de notre système immunitaire. Il contribue à la dégradation des glucides complexes, produit des vitamines, notamment la vitamine K et diverses vitamines B, et favorise l’absorption des nutriments.
Des déséquilibres du microbiome intestinal ont été associés à des affections telles que les maladies inflammatoires de l’intestin , l’obésité, le diabète de type 2 et les troubles de santé mentale, comme la dépression et l’anxiété.
Il existe différentes manières de maintenir un microbiome intestinal sain ou de le rééquilibrer lorsqu’il est déséquilibré. Parmi celles-ci, on peut citer la prise de probiotiques (bactéries bénéfiques) et de prébiotiques (fibres qui nourrissent les bactéries). On peut également envisager une transplantation de microbiote fécal (transfert de microbiote sain d’un donneur à un receveur), aussi appelée transplantation de selles.
Ces microbiomes présents dans notre corps ne sont pas des entités isolées. Ils interagissent entre eux de manière complexe. Par exemple, les microbiomes buccal et nasal peuvent influencer la santé de notre système respiratoire.
Les perturbations du microbiome intestinal peuvent influencer notre système immunitaire et affecter d’autres microbiomes. Le microbiome cutané peut interagir avec le microbiome génital et avec les microbes présents dans notre environnement.
La reconnaissance de l’interdépendance de ces biomes nous rappelle que notre corps est un écosystème holistique où les déséquilibres dans une zone peuvent avoir des conséquences sur l’ensemble du microbiome. Comprendre ces interactions ouvre de nouvelles perspectives pour améliorer la santé humaine.
Rédacteur Fetty Adler
Collaborateur Jo Ann
Auteurs : 1. Samuel J. White, Maître de conférences en immunologie génétique, Université Nottingham Trent au Royaume-Uni. 2. Philippe B. Wilson, Professeur de One Health, Université Nottingham Trent au Royaume-Uni. Cet article est republié du site The Conversation, sous licence Creative Commons.
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